Учащиеся по образовательным программам ординатуры и аспирантуры обучаются на базе клинических подразделений ФГБУ «НМХЦ им. Н.И. Пирогова» Минздрава России, оснащенных высокотехнологичным медицинским и учебным оборудованием на уровне мировых стандартов.